便秘是不会影响胚胎着床的，便秘是消化系统的症状。胚胎着床是生殖系统的生理表现，二者不是一个系统的疾病，所以不互相影响。胚胎着床的条件主要有合格的受精卵和正常的子宫内膜就可以。便秘会导致大便在肠道存留的时间长，大便过程中难免会出现大便用力的情况。这时只是胃肠道的压力增加，对于生殖系统是没有影响的。