坐骨直肠窝脓肿属于肛周脓肿的一种类型，而对于肛周脓肿的发病原因主要是由于肛腺感染所引起，因为肛腺开口是在肛窦处，而肛腺的开口是向上的，那么很容易导致粪便对肛窦产生作用而导致其发生撕裂伤。如果是稀便，那么很容易残留在肛窦，很容易引起肛窦发炎。从而引起炎症向肛管直肠周围软组织或其间隙内感染而引起肛周脓肿，其他的病因包括肛周皮肤感染、损伤、异物、药物注射和手术后并发感染等原因引起。