小脑幕切迹疝和枕骨大孔疝主要是病变部位、发病原因、早期临床表现等不同，具体如下：

　　1、病变部位

　　小脑幕切迹疝是发生在小脑幕切迹的病变，是指由于颅内压力持续升高使颞叶内侧的海马钩回向下发生移位，从而挤入小脑幕的裂孔，对小脑幕切迹的脑组织、神经、动脉等造成压迫，进而产生一系列后果。

　　枕骨大孔疝是发生在枕骨大孔处的病变，是指小脑扁桃体和邻近组织向下移位，进入枕骨大孔到达颈椎管上端的一种现象。

　　2、发病原因

　　小脑幕切迹疝可能是因为硬膜外血肿、颅内感染、颅内肿瘤等原因导致的;而枕骨大孔疝的基本病因是颅内压增高，诱发因素包括用力排便、不当的腰椎穿刺操作等。

　　3、早期临床表现

　　小脑幕切迹疝早期可出现频繁呕吐、躁动不安、意识障碍、瞳孔两侧不等大等症状;枕骨大孔疝早期可能出现颈部、后脑勺疼痛和吞咽困难、饮水呛咳、声音嘶哑等症状。