膝盖后面腘窝疼可能是过度牵拉、缺钙、腘窝囊肿导致，要根据自身的情况选择治疗的方法。

1、过度牵拉：如果长时间跑步登山和健身等运动，容易对周围的组织造成牵拉，导致膝盖后面腘窝疼，需要对局部进行按摩或者休息以后会逐渐的恢复。

2、缺钙：如果出现了骨质疏松，身体中的钙物质大量流失，也会产生膝盖后面腘窝疼，可以咨询医生使用碳酸钙片、乳酸钙片等。

3、腘窝囊肿：腘窝囊肿可能是遗传因素的原因，也会产生疼痛，可能需要通过手术切除治疗。

除了以上的原因，也有可能是出现了软组织损伤，根据情况选择相关的检查。