宫颈内纳囊不是癌症，是一种良性疾病，通常没有不适症状，不会导致病人生活质量下降，也不需要特殊临床处理。绝大多数是子宫颈的生理性变化，子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口或者伸入腺管，将腺管口堵塞，导致腺体引流物受阻，潴留形成囊肿。

宫颈损伤或者宫颈慢性炎症，也可以导致宫颈纳囊形成。但是有些表现为宫颈肥大的深部囊肿，无法进行临床确诊，需要与宫颈腺癌来进行鉴别诊断。