灰指甲长肉里特别疼可能是由于修剪不当、灰指甲感染引起的炎症等原因导致，可以穿舒适的鞋子、保持足部清洁干燥、使用药物等方法进行治疗。具体分析如下：

　　1、修剪不当

　　修剪不当就会导致灰指甲长肉里。指甲长到肉里，首先要对指甲部位进行消毒，同时还要对指甲刀进行消毒，再把指甲刀慢慢地伸到指甲和肉之间，让指甲微微向上，把长在肉里的指甲剪下来，就可以缓解指甲进入肉里的情况。

　　2、保持足部清洁干燥

　　灰指甲是由真菌感染引起的，如果感染严重，可能会引起炎症，导致疼痛和不适。保持足部清洁干燥，可以减少灰指甲感染的风险，同时也可以减轻疼痛和不适。

　　3、使用药物治疗

　　灰指甲也可以在医生的指导下使用抗真菌药物进行治疗，减轻炎症和疼痛。常用药物有使用氟胞嘧啶片、制霉菌素片、氟康唑胶囊等。

　　除此之外，如果灰指甲严重影响到生活质量，可以考虑在医生的指导下进行手术切除。如果灰指甲长肉里特别疼伴有其他症状，如红肿、发热、脓液等，应该及时就医，由医生进行诊断和治疗。