沙眼衣原体阳性一般是由于沙眼衣原体感染造成的，沙眼衣原体是导致沙眼的一个主要的致病菌，它是一个衣原体，和细菌还稍微有些差别，是一种微生物。沙眼衣原体在眼部的感染可能有两个血清型，一种是引起我们常说的沙眼，还有一种引起衣原体性的结膜炎。第一种引起沙眼的沙眼衣原体，它主要是在眼部发病，会引起眼部的滤泡形成，然后瘢痕形成，角膜上新生血管，最后严重的导致眼睑内翻和倒睫，这种目前随着卫生条件的改善，沙眼在逐渐在城市里面基本上已经消除了，很少会发现。还有一种是生殖器的沙眼衣原体，这种沙眼衣原体可以感染生殖器，同时也会感染眼部，引起包涵体性的结膜炎。