肛门上面的腚沟裂开疼可能是肛裂、肛周脓肿、肛瘘等疾病引起的，应该根据不同的疾病采取不同的治疗措施，具体如下：

1、肛裂：主要是因为齿状线以下肛管皮肤破裂形成棱形裂口或溃疡，通常在排便过程中，由于粪便干燥，容易擦破肛门皮肤，使病灶处的神经末梢受到刺激，立刻感到肛管烧灼样或刀割样疼痛，称为排便时疼痛，但是便后数分钟可缓解，随着肛门括约肌的收缩痉挛，再次出现肛门旁边及屁股里面的剧烈疼痛，同时让患者出现便中带血、便秘的症状。若是症状轻或初发的肛裂先考虑保守治疗，口服乳果糖或甘露醇注射液，合理控制饮食多吃水果蔬菜软化大便，每日温水坐浴等；若是症状较重或长久不愈可考虑手术治疗，如肛裂切除术、肛管内括约肌切断术等。

2、肛周脓肿：是指直肠肛管周围软组织或其周围间隙发生的急性化脓性感染，并形成脓肿，若是脓腔位置位于皮下较表浅，就能在肛门周围看见白色或黄白色脓头，当脓肿淤积过多，在肛门腚沟上的脓肿会破溃开裂。治疗方法应该以手术治疗为主，术式为肛门周围脓肿切开引流术，还可外加使用革兰阴性杆菌有效的抗生素，如头孢呋辛酯、头孢克洛、头孢西酮钠等。

3、肛瘘：因为大部分肛痿由直肠肛管周围脓肿引起，脓肿自行破溃处或切开引流处形成外口，由于外口生长较快，常表现为假性愈合，导致脓肿反复发作破溃形成多个窦道和外口，形成肛瘘。在肛瘘的瘘道中有脓肿形成时，可以感觉到明显肛门旁边及屁股里面的疼痛，同时还伴有反复发作的发热、肛门部位皮肤潮湿、瘙痒等症状。在治疗上通常是采取肛瘘切除术、瘘管切开术、肛瘘挂线疗法等手术方式治疗。