肛门上面有个小洞，肛瘘可能性大，但不一定就一定是肛瘘，还需考虑是肛周皮肤皲裂、肛周脓肿术后皮肤伤口不愈合等疾病，具体如下：

1、肛瘘：由直肠肛管周围脓肿引起，脓肿自行破溃处或切开引流处形成外口，由于外口生长较快，常假性愈合，导致脓肿反复发作破溃形成多个瘘管和外口，形成肛瘘，能看到肛瘘患者在肛门上面有个小洞，就称为肛瘘的窦道外口，还伴有反复发作的发热、肛门部位皮肤潮湿、瘙痒等症状。通常是采取肛瘘切除术、瘘管切开术、肛瘘挂线疗法等，术后还应该用高锰酸钾片坐浴，以及头孢噻肟钠注射进行抗炎治疗。

2、肛周皮肤皲裂：主要是由肛周湿疹引起，患者长时间的肛周瘙痒症状，患者自行搔抓，使肛周皮肤出现皲裂的小口，长期的反复发作，最后形成了肛门上有个小洞的现象，还会表现出肛周明显的疼痛和出血，引起肛周的感染。平时在便后采用高锰酸钾温水坐浴，保持肛周清洁，清淡饮食，禁止吃油腻辛辣刺激食物，平时穿宽松裤子，避免裤子摩擦裂口，同时结合局部涂抹派瑞松乳膏，促进皮肤皲裂的愈合。

3、肛周脓肿术后皮肤伤口不愈合：主要是因为患者术后排便后未及时坐浴及清洗或者每天换药没有彻底清除脓腔的分泌物，导致伤口长期的不愈合，通常会出现肛门上面有个小洞，还表现为肛周的红肿、伴有轻微的发热等。在治疗上要坚持每天彻底的换药，及时清除脓腔的分泌物、脓液的脓壁，同时排便后及时进行清洗和坐浴避免二次污染，可以口服阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片、头孢克洛缓释胶囊等抗感染药物。