来大姨妈通常指的是来月经。来月经眼睛不舒服可能是痛经、雌激素分泌异常，还可能是结膜炎等原因造成的。

1、痛经：如果来月经时腹部受凉，可能会使患者发生痛经，当痛经严重时，会影响到睡眠质量，导致睡眠不足而引起眼睛不舒服。建议在医生的指导下使用聚乙烯醇眼药水、玻璃酸钠眼药水进行缓解。

2、雌激素分泌异常：女性来月经时，体内的雌激素分泌会有所下降，当雌激素分泌异常时就可能会导致血管扩张，当机体血管扩张时，就可能会引起眼睛不舒服。建议在医生的指导下使用复方氯化钠、七叶洋地黄双苷等药物缓解。

3、结膜炎：女性在来月经时抵抗力比较低，容易受到细菌、病毒或是衣原体的感染，当眼睛受到感染时，可能会发生结膜炎，而出现眼睛不舒服的现象。建议在医生的指导下使用抗感染类药物治疗，如氧氟沙星、加替沙星等。